對于免疫性不孕癥的診斷仍未明確，主要是研究抗精子抗體、抗卵巢抗體、抗子宮內膜抗體等抗體對生殖的影響。近年來，研究者們把焦點放在同種免疫上，如外周血免疫細胞及子宮內膜微環境改變等對生殖的影響，但不論是自身抗體還是同種免疫對生殖的影響目前都在研究階段，暫無定論。因此，是否能夠根據自身抗體陽性或同種免疫的異常來作出免疫性不孕
癥的診斷也是值得深思和進一步探討的。
針對配子和器官的抗體針對配子和器官的抗體主要包括抗精子抗體、抗卵巢抗體、抗子宮內膜抗體和抗甲狀腺抗體等。之前有研究認為這些抗體可能會影響女性生殖，但有分析表明，抗精子抗體與體外受精－胚胎移植(IVF-ET)或胞漿內單精子注射(ICSI)的妊娠率無相關性。目前越來越多的研究認為抗精子抗體對妊娠率無明顯影響，因此其對臨床指導意義并不大。而對于抗卵巢抗體和抗子宮內膜抗體對生殖的影響目前尚無大樣本的薈萃分析，多數都是小樣本的觀察性研究，證據等級并不高。研究發現，甲狀腺功能正常的婦女，無論是否存在抗甲狀腺抗體，其臨床妊娠率相似。因此，單純抗甲狀腺抗體陽性似乎與妊娠率關系并不大，對于抗甲狀腺抗體陽性還應密切監測其甲狀腺功能。
抗磷脂抗體抗磷脂抗體主要與血栓形成和妊娠并發癥有關，目前對于抗磷脂抗體的研究越來越多，普遍認為抗磷脂抗體陽性可能導致流產的發生，至于抗磷脂抗體能否導致不孕仍需大樣本的前瞻性實驗進一步研究證實。
抗核抗體ANA對妊娠的影響研究結果不一，研究表明，ANA可對卵母細胞和胚胎的發育產生不利影響，導致妊娠和著床率降低。研究表明，ANA與首次接受IVF/ICSI治療的婦女的妊娠結局無關。因此，ANA是否影響妊娠仍存在一定的爭議。
